Una noche de tormenta, una mujer misteriosa deja a la pequeña Dorothy con los Gales en su granja en Lucas, Kansas. Veinte años después, Dorothy está a punto de reunirse con su madre biológica cuando un tornado la arrastra a la extraña Tierra de Oz. Allí encuentra a una tribu local que la prohíbe entrar en sus tierras por haber matado a la Bruja del Este. Desesperada por volver a casa, se embarca en un viaje en busca del Mago de Oz, el poderoso gobernador de la Ciudad Esmeralda el único que puede ser capaz de ayudarla. Por el camino se le une Lucas, un hombre sin memoria que espera que el Mago pueda ayudarle a recordar. Mientras tanto, el Mago manda a Eamonn a localizar a la intrusa, ya que la considera una amenaza a la seguridad de la Ciudad Esmeralda.
Glinda y la Bruja del Oeste organizan un funeral en memoria de la Bruja del Este que el Mago intenta boicotear en un intento de hacer que la gente tema a las brujas y su magia. Mientras tanto, Dorothy, Lucas y Toto continúan su viaje a la Ciudad Esmeralda mientras Eamonn y la guardia del Mago les pisan los talones. Cuando las heridas de Lucas empeoran, Dorothy lo lleva al boticario Mombi para buscar una medicina. Pronto descubren que Mombi tiene capturado a un joven llamado Tip que puede suponer una amenaza a su seguridad.
Los peores temores del Mago se ven confirmados cuando Anna revela que la Bestia llegará en doce días. La brecha en el cielo que llevó a Dorothy a Oz es el primer signo. Mientras tanto, Dorothy y Lucas llegan al castillo del Este en busca de una forma de llevar a la muchacha de vuelta a casa. Dorothy finge ser la nueva señora del Este e intenta entrar en un tornado, con la esperanza de que la lleve de vuelta a Kansas. Su plan no funciona, pero encuentra una bata de laboratorio que pertenecía a su madre. Lejos de allí Tip, que ha sido recientemente liberado, se entera de que es en realidad una chica y de que la magia de Mombi le hacía parecer un chico. El intento de Jack por reconfortarla solo hace que se enfade todavía más provocando un trágico desenlace.
Dorothy y Lucas se encuentran con una joven llamada Sylvie que posee el poder de convertir las cosas en piedra. Cuando Eamonn encuentra finalmente a Dorothy, es evidente que reconoce a Lucas. Los guardias del Mago capturan a Lucas y a Sylvie, pero Dorothy se las apaña para escapar. Mientras tanto, Jack despierta de su caída y se da cuenta de que gran parte de su cuerpo ha sido reemplazado por hojalata. Lady Ev ayudará a Jack a recuperarse y se da cuenta de quién es realmente. En la Ciudad Esmeralda Anna revela al Mago que la Bestia respira y tiene corazón y puede, por tanto, ser matada.
Mientras Ana va averiguando más información sobre la Bestia, el Mago continúa su cruzada para eliminar la magia de todo el reino. Como preparación para la inminente llegada de la Bestia, el Mago intenta persuadir a Lady Ev de que produzca armas para defender a la Ciudad Esmeralda. Mientras tanto, Tip decide unirse a la Bruja del Oeste con la esperanza de que su magia sea capaz de transformarla de nuevo en un chico. Cuando Oeste captura a Dorothy, Lucas y Sylvie intentarán ayudarla.
Un flashaback revela cómo el Mago acabó en Oz y qué tipo de hombre era antes de convertirse en el gobernador de la Ciudad Esmeralda. De vuelta al presente, la bruja del Oeste utiliza el amor que Dorothy siente por Lucas para conseguir acceso a sus recuerdos, que han sido mágicamente bloqueados por Glinda. Los recuerdos de Lucas revelan que Glinda está secretamente preparando brujas con el objetivo de derrocar al Mago. Confrontado por Dorothy, el Mago revela la máquina que lo llevó a Oz y promete dejarla volver a casa a cambio de que le ayude a parar a Glinda. Más tarde, el Mago intenta persuadir a Lady Ev de que produzca armamento para enfrentarse a las brujas y a su magia.
Paranoico a causa de las brujas, el Mago ordena a Eamonn reunir a todas las chicas jóvenes de la ciudad Esmeralda. Mientras tanto, Dorothy y Lucas viajan para llevar a Sylvie con Glinda. Por otro lado, y sin que Lucas se entere Dorothy ha sido enviada por el Mago a matar a Glinda a cambio de su billete de vuelta a casa. El romance entre Dorothy y Lucas vuelve a adquirir fuerza durante el viaje. Mientras tanto, el Mago comienza a pagar su enfado con su Consejo al descubrir el engaño de Glinda. Más tarde, Glinda restaura la memoria de Lucas, revelando una impactante verdad sobre su relación.
Dorothy se encuentra devastada cuando se entera de que Lucas es el marido de Glinda y una parte imprescindible de su plan. A pesar de que su memoria ha sido restaurada, Lucas sigue sintiendo algo por Dorothy. Después de pasar una noche con Ev, Jack se da cuenta de que su relación no es lo que esperaba. Mientras tanto, la bruja del Oeste ofrece a Tip el poder del Este, pero al beberse sus embrujos la cosa se complica y no sucede lo que se había planeado. Dorothy tratará de detener a Glinda, pero ahora Lucas está en medio de todo.
Tras los intentos frustrados de Dorothy por matar a Glinda, Lucas persigue a Dorothy con la intención de asesinarla. La muchacha intenta liberar a la mujer de Ojo de la Prisión de los Abyectos para que pueda devolver a la vida a los gigantes de piedra. Tip y la bruja del Oeste se unen para crear un ejército de brujas con las prisioneras recién liberadas. Mientras tanto, el Mago lanza un ataque sorpresa contra Ev. Jack intenta intervenir, pero sus acciones tendrán consecuencias inesperadas.
La bruja del Oeste entra en la Ciudad Esmeralda con el ejército de brujas liberadas de la Prisión de los Abyectos y Tip asume el lugar que le corresponde en el trono de Oz. Eamonn revela la impactante verdad sobre su pasado y como afectó a la vida de la chica. Mientras tanto, Dorothy entra en Oz con los gigantes de piedra y se libra una batalla entre los hombres del Mago y las brujas. Dorothy finalmente recibe la oportunidad de volver a casa, pero una sorprendente revelación le fuerza a reconsiderar en qué lugar se la necesita más. Con la verdadera Bestia a punto de llegar, puede que las aventuras de Dorothy en Oz no hayan hecho más que empezar.